Paysagiste français fut d’abord l’élève de son père, Jean-Louis Noirot, dessinateur, lithographe et peintre. Sur les conseils d’Armand Charnay, il vint à Paris, dans l’atelier de Cabanel. Il débuta au Salon de 1874 et devint peintre du ministère de la Marine. Au milieu des années 1870, il travailla avec Daubigny et Français, tous deux élèves de Corot et experts dans la technique du paysage, ce qui conduisit Émile Noirot dans la forêt de Fontainebleau et à Marlotte, où il se maria.

Dessinateur, peintre, aquarelliste, Noirot exposa pendant 40 ans au Salon des Artistes Français et dans différentes expositions internationales, dont Saint-Pétersbourg, Londres, Chicago et Venise, où il participa à la première biennale de cette ville en 1895. Dessinateur en archéologie, illustrateur dans divers ouvrages sur l’art roman en région roannaise et dans le Velay, il écrivit aussi dans la presse.